नैदानिक अभिकर्मकों
लार अधिक संवेदनशील है SARS-CoV-2 पता लगाना COVID-19 रोगियों से नासोफेरींजल स्वाब
January 22 , 2021


# SARS-CoV-2, COVID-19, लार, निदान किट


सार

तीव्र और सटीक SARS-CoV-2 नैदानिक ​​परीक्षण चल रहे नियंत्रण के लिए आवश्यक है COVID-19 महामारी के लिए वर्तमान स्वर्ण मानक COVID-19 निदान वास्तविक समय है। RT-PCR का पता लगाना SARS-CoV-2 से nasopharyngeal स्वैब्स कम संवेदनशीलता, स्वास्थ्य कार्यकर्ताओं के लिए जोखिम जोखिम, और स्वैब और व्यक्तिगत सुरक्षा उपकरणों की वैश्विक कमी, हालांकि, नए निदान की मान्यता की आवश्यकता है। लार एक होनहार उम्मीदवार है SARS-CoV-2 निदान क्योंकि (१) संग्रह न्यूनतम इनवेसिव है और मज़बूती से हो सकता है स्व-प्रशासित और (2) लार ने पिछले मानव अध्ययनों में स्थानिक मानव कोरोनावरिस सहित अन्य श्वसन रोगजनकों का पता लगाने में नासोफेरींजल स्वैब की तुलनात्मक संवेदनशीलता प्रदर्शित की है। को के लिए लार के उपयोग को सत्यापित करें SARS-CoV-2 पता लगाने, हम nasopharyngeal और लार के नमूनों का परीक्षण किया पुष्टि की गई COVID-19 रोगियों और स्वयं एकत्र नमूने स्वास्थ्य कर्मचारी पर COVID-19 वार्ड जब हमने तुलना की है। SARS-CoV-2 पता लगाना रोगी-मिलान nasopharyngeal

और लार के नमूनों में, हमने पाया कि लार ने अधिक संक्रमण संवेदनशीलता और निरंतरता प्राप्त की इसके अलावा, हम कम परिवर्तनशीलता की रिपोर्ट करते हैं। स्व-नमूना संग्रह लार एक साथ लिया, हमारे निष्कर्षों से पता चलता है कि लार नासफोरींजियल स्वाब के लिए एक व्यवहार्य और अधिक संवेदनशील विकल्प है और कर सकती है। सक्षम घर पर स्व-प्रशासित सटीक बड़े पैमाने के लिए नमूना संग्रह SARS-CoV-2 परीक्षण

परिचय

SARS-CoV-2, उपन्यास को नियंत्रित करने के प्रयास कोरोनावायरस कारण COVID-19 महामारी, सटीक और तेजी से निदान पर निर्भर करती है। परीक्षण ये परीक्षण होना चाहिए ( 1 ) प्रभावी आत्म अलगाव को बढ़ावा देने और उच्च जोखिम के भीतर संचरण को कम करने के लिए हल्के और स्पर्शोन्मुख संक्रमणों के प्रति संवेदनशील। group1 ) रोग की प्रगति और सहायता नैदानिक ​​की लगातार निगरानी करने के लिए लगातार निर्णय 2 और ( ) स्थानीय और राष्ट्रीय सार्वजनिक स्वास्थ्य नीतियों को सूचित करने योग्य, जैसे कि कब सामाजिक दूर करने के उपायों को सुरक्षित रूप से आराम दिया जा सकता है हालाँकि, करंट SARS-CoV-2 परीक्षण की रणनीति अक्सर पूरी नहीं हो पाती है मानदंड, भाग में क्योंकि - का उनका वास्तविक समय के लिए व्यापक रूप से अनुशंसित नमूना प्रकार के रूप में नासोफेरींजल स्वाब पर निर्भरता आरटी-पीसीआर

हालांकि nasopharyngeal swabs आमतौर पर श्वसन वायरस निदान में उपयोग किया जाता है, वे के लिए अपेक्षाकृत खराब संवेदनशीलता दिखाएं। SARS-CoV-2 प्रारंभिक संक्रमण का पता लगाने और कर रहे हैं 2–6 असंगत के दौरान सीरियल टेस्टिंग इसके अलावा, nasopharyngeal swabs को इकट्ठा करने से रोगियों को असुविधा होती है आक्रमण, दोहराने परीक्षण के लिए अनुपालन को सीमित करना, और स्वास्थ्य कार्यकर्ताओं के लिए काफी जोखिम प्रस्तुत करता है; क्योंकि यह मरीजों को छींकने या खांसी के लिए प्रेरित कर सकता है, वायरस को बाहर निकाल सकता है। कण 7 प्रक्रिया भी बड़े पैमाने पर परीक्षण के लिए अनुकूल नहीं है; क्योंकि स्वास्थ्य सेवा के लिए स्वैब और व्यक्तिगत सुरक्षा उपकरणों की व्यापक कमी है , और आत्म-संग्रह nasopharyngeal swabs वायरस के लिए कठिन और कम संवेदनशील है। डिटेक्शन 9 ये चुनौतियों को और बढ़ा दिया जाएगा। COVID-19 कम आय में महामारी तीव्र देशों दी गई सीमाएँ, एक अधिक विश्वसनीय और कम संसाधन-गहन नमूना संग्रह विधि, आदर्श रूप से एक जो समायोजित करता है स्व-संग्रह घर में, तत्काल जरूरत है लार का नमूना nasopharyngeal swab; लार एकत्र करना है गैर इनवेसिव और आसान है। स्व-प्रशासन के लिए nasopharyngeal और लार संघनन का विश्लेषण RT-PCR दो मौसमी सहित श्वसन रोगजनकों का पता लगाना

मानव कोरोनवीरस, दो नमूने के बीच तुलनीय नैदानिक ​​संवेदनशीलता का सुझाव देता है 10,11 है COVID-19 रोगियों और ( ) स्व-एकत्रित लार के नमूने हैं। तुलनीय प्रारंभिक निष्कर्ष बताते हैं कि ( 1 ) SARS-CoV-2 पता लगाया जा सकता है से लार १२ टाइपमार्स-सीओवी -2 स्वास्थ्य सेवा द्वारा एकत्र नासोफेरींजल स्वैब के प्रति संवेदनशीलता का पता लगाना १३कार्यकर्ताओं से सौम्य और उपवर्गीय COVID-19 मामले आलोचनात्मक रूप से, हालांकि, सार्स-कोव -2 की संवेदनशीलता का कोई कठोर मूल्यांकन नहीं किया गया है nasopharyngeal swabs के संबंध में लार का पता लगाने का आयोजन किया गया है inpatients के दौरान का कोर्स COVID-19 संक्रमण

इस अध्ययन में, हमने मूल्यांकन किया। SARS-CoV-2 युग्मित नासोफेरींजल स्वाब और लार के नमूनों का पता लगाना COVID-19 inpatients और स्पर्शोन्मुख स्वास्थ्य कार्यकर्ताओं पर मध्यम से उच्च जोखिम COVID-19 एक्सपोज़र हमारे परिणाम संकेत देते हैं कि लार का उपयोग करना SARS-CoV-2 पता लगाना अधिक संवेदनशील और सुसंगत है nasopharyngeal का उपयोग करना कुल मिलाकर, हम प्रदर्शित करते हैं कि लार एक विश्वसनीय नमूना प्रकार को कम करने के लिए माना जाता है। COVID-19 परीक्षण मांगें

परिणाम

उच्च SARS-CoV-2 टाइटर्स का पता चला लार से nasopharyngeal swabs से inpatients
को निर्धारित करें कि क्या लार प्रदर्शन के साथ-साथ यू.एस. के लिए nasopharyngeal swabs का उपयोग करने की सीडीसी सिफारिश SARS-CoV-2 निदान, हमने नैदानिक ​​नमूने एकत्र किए 44 COVID-19 inpatient अध्ययन प्रतिभागियों ( तालिका एक )) यह cohort की एक श्रृंखला का प्रतिनिधित्व करता है COVID-19 गंभीर रोग के रोगियों के साथ, 19 (43%) गहन देखभाल की आवश्यकता, 10 (23%) आवश्यक यांत्रिक वेंटिलेशन, और 2 (5%) अप्रैल 5 के रूप में मृतक, 2020 यू का उपयोग कर cdc SARS-CoV-2 आरटी-पीसीआर परख, हमने परीक्षण किया 121 स्व-एकत्रित लार या स्वास्थ्य सेवा कार्यकर्ता प्रशासित nasopharyngeal swabs से यह हम यू। के बीच मजबूत सहमति मिली cdc "N1" और "N2" प्राइमर-जांच सेट ( विस्तारित डेटा अंजीर 1), और इस प्रकार गणना की गई वायरस टाइटर्स (वायरस प्रतियां / एमएल) केवल का उपयोग करते हुए "N1" सेट से सभी सकारात्मक नमूनों का परीक्षण किया गया ( एन = 46 नासोफेरींजल, 37 लार), हमने पाया है कि ज्यामितीय माध्य वायरस टाइटर्स से सलाइवा के बारे में थे 5⨉ से अधिक nasopharyngeal swabs ( पी < 0.05, मान-व्हिटनी परीक्षण अंजीर 1 ए )) जब केवल हमारे विश्लेषण को सीमित करना। रोगी-मिलान nasopharyngeal और लार के नमूने ( एन = 38 प्रत्येक नमूना प्रकार के लिए), हमने पाया है कि SARS-CoV-2 टाइटर्स से लार काफी अधिक थी की तुलना में nasopharyngeal swabs ( पी = 0.0001, विलकॉक्सन परीक्षण अंजीर 1 बी )) इसके अलावा, हमने पता लगाया है। SARS-CoV-2 से लार लेकिन नहीं nasopharyngeal swabs आठ मिलान नमूने (21%), जबकि हमने केवल पता लगाया था। SARS-CoV-2 से nasopharyngeal swabs और लार नहीं तीन मिलान किए गए नमूने (8%; अंजीर 1 सी )) कुल मिलाकर, हमने उच्चतर पाया। SARS-CoV-2 टाइटर्स से लार से nasopharyngeal swabs से अस्पताल

तालिका 1. COVID-19 inpatient कोहोर्ट विशेषताओं

आकृति 1. SARS-CoV-2 चिरायता लार में अधिक होता है की तुलना में nasopharyngeal swabs से अस्पताल ) सभी सकारात्मक नासोफेरींजल स्वाब ( एन = 46) और लार के नमूने ( एन = 39) a मान-व्हिटनी परीक्षण ( पी < 0.05) सलाखों मंझला का प्रतिनिधित्व करते हैं और 95% सीआई हमारे परख का पता लगाने की सीमा SARS-CoV-2 हमें का उपयोग करते हुए सीडीसी "एन 1" परख चक्र दहलीज 38 पर है, जो 5,610 वायरस से मेल खाती है। प्रतियां / एमएल नमूना (दिखाया गया है। बिंदीदार रेखा और ग्रे क्षेत्र) ) रोगी के नमूनों का मिलान ( एन = 38), कनेक्टिंग लाइनों द्वारा दर्शाए गए, की तुलना ए विलकोक्सन परीक्षण परीक्षण ( पी < 0.05) सी ) रोगी के नमूनों का मिलान ( एन = 38) एक तितर बितर पर भी प्रतिनिधित्व कर रहे हैं कच्चे चक्र थ्रेसहोल्ड सहित इस आंकड़े को उत्पन्न करने के लिए उपयोग किए जाने वाले सभी डेटा में पाया जा सकता है अनुपूरक डेटा 1  विस्तारित डेटा अंजीर 1हमारे बीच सहसंबंध दिखाता है सीडीसी परख "N1" और "N2" परिणाम

कम अस्थायी SARS-CoV-2 परिवर्तनशीलता जब परीक्षण लार से inpatients

as टेम्पोरल SARS-CoV-2 नैदानिक ​​परीक्षण से nasopharyngeal swabs होने की सूचना है 2,3 चर, हम अनुदैर्ध्य nasopharyngeal और लार के नमूनों का परीक्षण किया रोगियों को यह निर्धारित करने के लिए कि कौन सा नमूना प्रकार अधिक सुसंगत प्रदान करता है परिणाम से 22 प्रतिभागियों में कई नासोफेरींजल स्वाब और कई प्रतिभागियों में कई लार के नमूने हैं, हमने पाया है कि SARS-CoV-2 लक्षण की शुरुआत की तारीख के बाद दोनों प्रकार के नमूने में आम तौर पर कमी आई है अंजीर 2 ए )) हमारे nasopharyngeal swab परिणाम के अनुरूप हैं 2,3 चर की पिछली रिपोर्ट SARS-CoV-2 titers और परिणाम : हमें 5 उदाहरण मिले। जहां ए प्रतिभागी nasopharyngeal swab के लिए नकारात्मक था SARS-CoV-2 एक सकारात्मक परिणाम के बाद अगला संग्रह (५ ( / ३३ दोहराता है; ३३%; ) अंजीर 2 बी ) अनुदैर्ध्य लार संग्रह में 12 रोगियों, हालांकि, कोई उदाहरण नहीं था जिसमें एक नमूना नकारात्मक परीक्षण किया गया था और बाद में एक सकारात्मक परिणाम था के रूप में सही नकारात्मक परीक्षण के परिणाम चिकित्सकों के लिए रोगी सुधार को ट्रैक करने और डिस्चार्ज के बारे में निर्णय लेने के लिए महत्वपूर्ण हैं, हमारे डेटा से पता चलता है कि लार एक अधिक सुसंगत नमूना प्रकार है। अस्थायी परिवर्तनों की निगरानी के लिए नासॉफिरिन्जियल स्वैब SARS-CoV-2 टाइटर्स

चित्र 2: SARS-CoV-2 पता लगाने के साथ दोहराने नमूना संग्रह के बीच कम चर है। लार ए) अनुदैर्ध्य SARS-CoV-2 टाइटर्स से लार या नासोफेरींजल स्वाब दिनों के रूप में दिखाए जाते हैं लक्षण शुरुआत प्रत्येक सर्कल एक अलग नमूने का प्रतिनिधित्व करता है, जो अतिरिक्त नमूनों से जुड़ा होता है एक ही रोगी एक धराशायी लाइन हमारे परख का पता लगाने की सीमा SARS-CoV-2 हमें का उपयोग करते हुए सीडीसी "एन 1" परख चक्र दहलीज 38 पर है, जो 5,610 वायरस से मेल खाती है। प्रतियां / एमएल नमूना (दिखाया गया है। बिंदीदार रेखा और ग्रे क्षेत्र) ) डेटा भी नमूना पल द्वारा दिखाए जाते हैं (क्रमिक संग्रह समय) संग्रह के बीच वायरस टिटर्स में अंतर को उजागर करने के लिए अंक कच्चे चक्र थ्रेसहोल्ड सहित इस आंकड़े को उत्पन्न करने के लिए उपयोग किए जाने वाले सभी डेटा में पाया जा सकता है अनुपूरक डेटा 1 

अधिक सुसंगत स्व-नमूना से लार का उपयोग करते हुए स्वास्थ्य कर्मचारी

उपखंड के पता लगाने के लिए लार मान्य करना SARS-CoV-2 संक्रमण साबित परिवर्तनकारी दूरस्थ रोगी निदान और स्वास्थ्य कार्यकर्ता दोनों के लिए निगरानी को इसकी जाँच करें, हमने 98 स्पर्शोन्मुख स्वास्थ्य सेवा श्रमिकों को नामांकित किया है हमारे अध्ययन और एकत्र लार और / या nasopharyngeal swabs औसतन हर 2.9 दिन (रेंज = 1-8 दिन तालिका 2 )) को दिनांक, हमने पता लगाया है। SARS-CoV-2 लार में से दो स्वास्थ्य वर्कर जो nasopharyngeal swabs द्वारा नकारात्मक थे, हम दोनों का उपयोग करते हुए cdc "N1" और "N2" परीक्षण और किसी भी रिपोर्ट नहीं किया। लक्षण लार से एक ये व्यक्तियों ने फिर से मिलान किए गए नकारात्मक नासोफेरींजल स्वाब के साथ सकारात्मक परीक्षण किया 2 दिन बाद परीक्षण करना वायरस के टाइटर्स से स्पर्शोन्मुख स्वास्थ्य सेवा श्रमिक ' लार कम है की तुलना में क्या हम आम तौर पर रोगसूचक inpatients ( अंजीर 3 ए ), जो संभावना की कमी का समर्थन करता है। लक्षण

हमारे सीमित डेटा का समर्थन करता है कि लार स्पर्शोन्मुख या पूर्व-रोगसूचक का पता लगाने के लिए अधिक संवेदनशील हो सकती है संक्रमण हालाँकि, एक बड़ा नमूना आकार की आवश्यकता है। पुष्टि करें nasopharyngeal swab नमूना असंगति के रूप में झूठी नकारात्मक के लिए संभावित मुद्दों में से एक हो सकता है। ( अंजीर २), उचित नमूना संग्रह के लिए एक आंतरिक नियंत्रण की निगरानी, ​​मानव rnase P, एक वैकल्पिक मूल्यांकन प्रदान कर सकता है। तकनीक जबकि मानव rnase p का पता लगाना बेहतर था दोनों रोगी और स्वास्थ्य वर्कर सहकर्मियों में लार अंजीर 3 बी ) , यह अकेले बेहतर वायरस का संकेत नहीं दे सकता है इससे भी महत्वपूर्ण बात, हमने पाया कि मानव rnase p पता अधिक परिवर्तनशील था nasopharyngeal swabs एकत्र किया inpatients ( पी = 0.0001, एफ परीक्षण के लिए (संस्करण) और स्व-एकत्रित स्वास्थ्य कार्यकर्ता ( पी = 0.0002 ; अंजीर 3 बी )) हमारे परिणाम बताते हैं कि लार भी एक उपयुक्त हो सकता है, और शायद अधिक संवेदनशील, स्पर्शोन्मुख या स्क्रीनिंग के लिए नासॉफिरिन्जियल स्वैब का विकल्प। पूर्व-रोगसूचक SARS-CoV-2 संक्रमण

टेबल 2. स्वास्थ्य कार्यकर्ता कामगार

आकृति 3. लार एक विकल्प है SARS-CoV-2 स्क्रीनिंग से स्वास्थ्य कार्यकर्ता और स्पर्शोन्मुख मामलों ) SARS-CoV-2 से मापा टाइटर्स स्वास्थ्य कर्मचारियों की लार और inpatients हमारे परख का पता लगाने की सीमा SARS-CoV-2 हमें का उपयोग करते हुए सीडीसी "एन 1" परख चक्र दहलीज 38 पर है, जो 5,610 वायरस से मेल खाती है। प्रतियां / एमएल नमूना (दिखाया गया है। बिंदीदार रेखा और ग्रे क्षेत्र) ) आरटी-पीसीआर साइकिल थ्रेसहोल्ड (सीटी) मानव rnase पी के लिए मान, और नमूना संग्रह के लिए आंतरिक नियंत्रण; से या तो inpatients (बाएं पैनल) या स्वास्थ्य देखभाल कार्यकर्ता (दाएं पैनल) च परीक्षण का उपयोग कर variances द्वारा तुलना की गई ( पी = 0.0001 के लिए पी = 0.0002 स्वास्थ्य सेवा के लिए कार्यकर्ता) कच्चे चक्र थ्रेसहोल्ड सहित इस आंकड़े को उत्पन्न करने के लिए उपयोग किए जाने वाले सभी डेटा में पाया जा सकता है अनुपूरक डेटा 1 

विचार-विमर्श

हमारे अध्ययन से पता चलता है कि लार nasopharyngeal swabs के लिए एक व्यवहार्य और बेहतर विकल्प है। SARS-CoV-2 पता लगाना हम पाया गया कि सार्स की संवेदनशीलता - SARS-CoV-2 पता लगाना लार तुलनीय है, यदि प्रारंभिक अस्पताल में भर्ती में नासोफेरींजल स्वाब से बेहतर नहीं है और इसके दौरान अधिक सुसंगत है विस्तारित अस्पताल में भर्ती और वसूली इसके अलावा, SARS-CoV-2 से नकारात्मक मिलान किए गए नासोफेरींजल स्वाब के बावजूद दो स्पर्शोन्मुख स्वास्थ्य सेवा कार्यकर्ताओं की लार से पता चलता है कि लार हल्के या उप-अवशिष्ट की पहचान के लिए एक व्यवहार्य विकल्प भी हो सकता है। साथ आगे सत्यापन, लार के नमूने का व्यापक कार्यान्वयन हो परिवर्तनकारी सार्वजनिक स्वास्थ्य के लिए प्रयास: लार स्वयं संग्रह प्रत्यक्ष स्वास्थ्य देखभाल की आवश्यकता को कम करता है बातचीत, का एक स्रोत 14–16 कई प्रमुख परीक्षण अड़चनों और समग्र नोसोकोमियल संक्रमण जोखिम, और स्वैब और व्यक्तिगत सुरक्षा उपकरणों पर आपूर्ति मांगों को कम करते हैं।

एसएआरएआरएस-सीओवी -2 वीरालोड्सडिफिफेटबेटनमाइल्डबैंडसैकेसेस , हमारे अध्ययन की एक सीमा प्राथमिक फोकस है। COVID-19 inpatients, गंभीर के साथ कई बीमारी जबकि अधिक डेटा के लिए अधिक सख्ती से संक्रमण के दौरान पहले से ही अस्पताल सेटिंग में लार की प्रभावकारिता की तुलना करना आवश्यक है, निष्कर्ष हाल के दो अध्ययन इसकी क्षमता का समर्थन करते हैं 13,18 है पता लगाना SARS-CoV-2 से दोनों स्पर्शोन्मुख व्यक्ति और बाह्य रोगी जैसा १२ संक्रामक वायरस का पता चला है की लार COVID-19 रोगियों, लार में वायरस जीनोम प्रतियां और संक्रामक वायरस कणों के बीच संबंध का पता लगाने १ ९ पूर्व रोगसूचक व्यक्तियों की गतिशीलता को समझने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाएंगे 1,20 हैस्पर्शोन्मुख संचरण

स्टेमिंग से के लिए आशाजनक परिणाम SARS-CoV-2 स्पर्शोन्मुख 13 में पता लगाना

व्यक्तियों, asalivaSARS-CoV-2detectionassayhasalreadygainedapprovalthroughh 18

अमेरिका खाद्य और औषधि प्रशासन आपातकालीन उपयोग प्राधिकरण को बढ़ती हुई परीक्षण मांगों को पूरा करना, हालाँकि, हमारे निष्कर्ष लार्व के तत्काल सत्यापन और कार्यान्वयन की आवश्यकता का समर्थन करते हैं SARS-CoV-2 प्रमाणित नैदानिक ​​में निदान प्रयोगशालाओं

तरीकों

आचार विचार

सभी अध्ययन प्रतिभागियों को येल विश्वविद्यालय के अनुसार नामांकित और नमूना लिया गया था। HIC- अनुमोदित प्रोटोकॉल # 2000027690 अध्ययन प्रतिभागी द्वारा स्वीकार किए जाने के बाद ही जनसांख्यिकी, नैदानिक ​​डेटा और नमूने एकत्र किए गए थे अध्ययन प्रोटोकॉल को समझा था और सूचित पर हस्ताक्षर किए थे। सहमति सभी प्रतिभागियों की जानकारी और नमूने अध्ययन के साथ एकत्र किए गए थे। पहचानकर्ता

प्रतिभागी नामांकन

inpatients
रोगियों को नए हेले अस्पताल में भर्ती कराया गया ( 1541-बिस्तर नए हेवेन, सीटी, यूएसए में तृतीयक देखभाल चिकित्सा केंद्र), जिन्होंने के लिए सकारात्मक परीक्षण किया SARS-CoV-2 nasopharyngeal और / या oropharyngeal swab (CDC अनुमोदित परख) अनुसंधान में दाखिला लेने के लिए आमंत्रित किया गया था। अध्ययन बहिष्करण मानदंड 18 वर्ष से कम आयु का था; गैर-अंग्रेजी एक गैर संक्रामक के लिए बोलना और नैदानिक, रेडियोलॉजिकल या प्रयोगशाला साक्ष्य बुखार या श्वसन लक्षणों का कारण या एक सूक्ष्मजीवविज्ञानी पुष्टि संक्रामक स्रोत (जैसे जठरांत्र, मूत्र, हृदय।) अन्य से लक्षणों के लिए श्वसन पथ और बिना किसी संदेह के COVID-19 संक्रमण

स्वास्थ्य देखभाल करने वाला श्रमिक
स्पर्शोन्मुख स्वास्थ्य सेवा कार्यकर्ता (जैसे, बुखार या श्वसन के बिना। लक्षण) रोगियों के साथ व्यावसायिक जोखिम के साथ COVID-19 में दाखिला लेने के लिए आमंत्रित किया गया था। अध्ययन अध्ययन की भागीदारी ने सक्रिय निगरानी को सुनिश्चित किया ताकि जोखिम का पता लगाने और अन्य स्वास्थ्य देखभाल श्रमिकों और रोगियों की रक्षा करने के लिए शुरुआती निगरानी सुनिश्चित हो सके

नमूना संग्रह

inpatients
nasopharyngeal और लार के नमूने हर तीन दिनों में प्राप्त किए गए थे नैदानिक ​​ पाठ्यक्रम nasopharyngeal नमूने bd सार्वभौमिक वायरल परिवहन का उपयोग करके पंजीकृत नर्सों द्वारा लिए गए थे (UVT) सिस्टम लचीली, मिनी-टिप स्वाब के माध्यम से पारित किया गया था - रोगी नासिका जब तक बाद के नासोफरीनक्स तक पहुंच गया था, स्राव को अवशोषित करने के लिए कई सेकंड के लिए जगह में छोड़ दिया गया और फिर धीरे-धीरे हटा दिया गया। स्वाब को बाँझ वायरल ट्रांसपोर्ट मीडिया में रखा गया था (कुल वॉल्यूम 3 एमएल) और सील सुरक्षित रूप से लार के नमूने स्व-एकत्र किए गए थे। रोगी पर जागने, रोगियों को भोजन, पानी और दांतों को ब्रश करने से बचने के लिए कहा गया नमूना एकत्र किया गया था मरीजों को बार-बार थूकने के लिए कहा गया एक बाँझ मूत्र कप मोटे तौर पर तरल से भरा तीसरा (बुलबुले को छोड़कर) सुरक्षित रूप से बंद करने से पहले यह सभी नमूनों को कमरे के तापमान पर संग्रहीत किया गया था और नमूना संग्रह के 5 घंटे के भीतर सार्वजनिक स्वास्थ्य के येल स्कूल में अनुसंधान प्रयोगशाला में ले जाया गया था।

स्वास्थ्य देखभाल करने वाला श्रमिक
स्वास्थ्यकर्मियों को एकत्र करने के लिए कहा गया था nasopharyngeal swab और 2 साल की अवधि के लिए हर तीन दिनों में एक लार का नमूना सप्ताह नमूने संग्रहीत किए गए थे + 4 ° C तक अनुसंधान के लिए ले जाया जा रहा है प्रयोगशाला

SARS-CoV-2 खोज

अनुसंधान प्रयोगशाला में आने पर, कुल न्यूक्लिक एसिड निकाला गया था से 300 μl की वायरल परिवहन मीडिया से nasopharyngeal swab या 300 μl का उपयोग कर पूरे लार की MagMAX वायरल / रोगज़नक़ न्यूक्लिक एसिड अलगाव किट (थर्मोफिशर वैज्ञानिक) निम्नलिखित निर्माता का प्रोटोकॉल और eluted में 75 μl of elution बफर के लिए SARS-CoV-2 शाही सेना 21,22 है पता लगाना, 5 μl आरएनए टेम्प्लेट का पहले जैसा वर्णन किया गया था, हमें वास्तविक समय का उपयोग करते हुए आरटी-पीसीआर प्राइमर / जांच के लिए सेट 2019-nCoV_N1 और 2019-nCoV_N2 और मानव rnase p (RP) एक निष्कर्षण के रूप में नियंत्रण नमूनों को सकारात्मक के रूप में वर्गीकृत किया गया था। SARS-CoV-2 जब दोनों N1 और एन 2 प्राइमर-जांच सेट का पता चला था। <38 सी वायरस प्रतियां थीं टी एक 10-गुना का उपयोग कर मात्रा निर्धारित आरएनए के कमजोर पड़ने के मानक वक्र जो हम पहले दिखाते हैं २१उत्पन्न परिणाम के रूप में एन १ और एन 2 तुलनीय थे विस्तारित डेटा अंजीर 1), सभी वायरस प्रतियों को N1 का उपयोग करके गणना के रूप में दिखाया गया है प्राइमर-जांच सेट

सांख्यिकीय विश्लेषण

सांख्यिकीय विश्लेषण आयोजित किए गए। ग्राफपैड प्रिज्म 8.0.0 जैसा कि वर्णित है परिणाम

स्वीकृतियां

हम आभार के लिए अध्ययन प्रतिभागियों को स्वीकार करते हैं समय और प्रतिबद्धता के अध्ययन के लिए हम क्लिनिकल टीम के सभी सदस्यों को धन्यवाद येल-न्यू हेवन अस्पताल के लिए समर्पण और काम जिससे यह अध्ययन संभव हुआ हम भी धन्यवाद एस टेलर और पी। तकनीकी के लिए जैक चर्चा

वित्त पोषण

अध्ययन आंशिक रूप से वैश्विक के लिए येल इंस्टीट्यूट द्वारा वित्त पोषित किया गया था। स्वास्थ्य संबंधित लेखकों के अध्ययन में सभी डेटा तक पूर्ण पहुंच थी और उनके पास अंतिम प्रकाशन के लिए निर्णय लेने की जिम्मेदारी थी। प्रकाशन

विस्तारित डेटा

विस्तारित डेटा अंजीर 1. के बीच की सहमति SARS-CoV-2 सीडीसी "एन 1" का उपयोग करके पता लगाना और "N2" प्राइमर और जांच सेट ct = आरटी-पीसीआर चक्र दहलीज बिंदीदार रेखा और धूसर क्षेत्र संकेत की सीमाओं का पता लगाते हैं

संदर्भ

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AnneL.Wyllie1 *, JohnFournier2, ArnauCasanovas-Massana1, MelissaCampbell2, MariaTokuyama3, Pavithra विजयकुमार 4 ; बर्टी गेंग 4 एम। कैथरीन म्यूनेकर 1 , एडम जे मूर 1 , चंटल B.F. वोगल्स १ , मेरी ई पेट्रोन 1 इसाबेल एम ओटी 5, पेवेन लु 3 , अरविंद वेंकटरमन 3 ; एलिस लू-क्यूलिगन 3 , जोनाथन क्लेन 3 , rebecca बयाना 1 , माइकल सिमोनोव 6 , रूपक दत्ता २ ; रयान हैंडोको 2 , निदा नौशाद 2 लोरेंजो आर सेवनान 2 , जोर्डन वाल्डेज़ 2 , एलिजाबेथ बी श्वेत 1 , सारा लापीदस 1 , चन्नी सी कलिनिच 1 , Xiaodong जियांग 3 , डैनियल जे किम 3 ; ईरीको कुडो 3 , मेलिसा लाइनहान 3 ; तियानयांग माओ 3 , मियु मोरियमा 3 , जी यूं ओह 3 , अन्नसीया पार्क 3 , जूलियो सिल्वा 3 ; एरिक गीत 3 , ताहीरो ताकाहाशी 3 , मनाबू तोरा 3 ओर्र-एल वीज़मैन 3 , पेट्रिक वोंग 3 ; यक्षिन यांग 3 , santos बरमेज़ो 7 , कैमिला Odio8 , साद बी ओमेर 1,2,9,10, चार्ट एस देरी क्रूज़ 7 , शेलिफ़र्हादियान 2, रिचर्ड ए.मार्टिनेलो 2,7,11, अकीकोइवासाकी 3,12, नाथनडी.गुरुबॉघ 1 # *, अल्बर्टी.को 1 # *

माइक्रोबियल रोगों की महामारी विज्ञान के 1 विभाग, सार्वजनिक स्वास्थ्य के येल स्कूल, नई हेवेन, सीटी 06510, संयुक्त राज्य अमेरिका के 2 विभाग, संक्रामक रोगों के अनुभाग, येल स्कूल ऑफ मेडिसिन, नए हेवन, सीटी, 06510, संयुक्त राज्य अमेरिका
3 डिपार्टमेंट ऑफ इम्युनोबायोलॉजी, येल स्कूल ऑफ मेडिसिन, न्यू हेवन, सीटी, 06510, यूएसए
4 प्रसूति विभाग, स्त्री रोग, और प्रजनन विज्ञान, येल स्कूल ऑफ मेडिसिन, नई हेवन, सीटी, 06510, यूएसए
5 पारिस्थितिकी और विकासवादी जीवविज्ञान विभाग, येल विश्वविद्यालय, न्यू हेवन, सीटी 06520, यूएसए
एप्लाइड ट्रांसलेशनल रिसर्च के 6 प्रोग्राम, येल स्कूल ऑफ मेडिसिन, न्यू हेवन, सीटी, 06510, यूएसए
7 आंतरिक चिकित्सा विभाग, पल्मोनरी का विभाग, क्रिटिकल केयर, और स्लीप मेडिसिन, येल स्कूल ऑफ मेडिसिन, न्यू हेवन, सीटी, 06510, यूएसए
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9 येल इंस्टीट्यूट ऑफ ग्लोबल हेल्थ, न्यू हेवन, सीटी 06510, यूएसए
10 येल स्कूल ऑफ नर्सिंग, न्यू हेवन, सीटी 06510, यूएसए
11 संक्रमण का विभाग रोकथाम; येल-नई हेवन हेल्थ, नई हेवन, सीटी। 06520
12 हावर्ड ह्यूजेस मेडिकल इंस्टीट्यूट, न्यू हेवन, सीटी 06510, यूएसए

# संयुक्त वरिष्ठ लेखक
* पत्राचार: anne.wyllie@yale.edu (ALW) nathan.grubaugh@yale.edu (NDG) albert.ko@yale.edu (एआईके)


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